1、金税三期系统工程可以有效的优化纳税服务，通过信息网络为纳税人提供优质、便捷、全方位的税收服务;逐步实现纳税人可以足不出户轻松办税，从而大大减轻纳税人办税负担。

　　2、有效的统一国、地税核心征管应用系统版本，实现业务操作和执法标准统一规范，促进税务部门管理职能变革;实现全国数据大集中，利用及时全面准确的数据信息，提高决策的科学化水平和税收征管水平，有效降低税收成本。

　　3、金三增加了纳税评估系统，对诚信纳税提出了更高的要求。系统会定期或不定期对纳税人的纳税情况进行分析，一方面对因客观原因造成的少缴或不缴税款给予及时提醒，另一方面对故意少缴或者不缴税款的事实进行处罚，并纳入纳税人的诚信系统。

　　4、是有力地推动国家电子政务建设，促进政府部门间信息共享和协作，为提高国家宏观经济管理能力和决策水平提供全方位支持，从而对社会的经济建设和社会发展产生积极而重要的作用。

　　5、税收环境更加公平：税收信息也更加公开透明，税收分析比对更加高效便捷，将进一步促进税务机关规范税收执法和管理行为，最大限度地减少“人情税”、“关系税”，减少税收执法的随意性，这样就为纳税人创造一个更加公平的税收环境。

　　6、有利于加强内部管理。金税三期上线后，应用网络发票系统可以杜绝虚开、代开、开具“大头小尾”发票的违法行为，帮助企业规避不法分子利用假票骗税所带来的财务风险，保护企业的合法经济利益。

　　7、金税三期上线后，将统一国、地税核心征管应用系统，实现业务操作和执法标准统一规范;实现全国数据大集中，及时利用全面准确的数据信息，将使税务机关的管理工作更加高效，为纳税人的服务更加准确、到位。